Hola..
Pudes hacer dos cosas.. una formatear y empezar de cero o simplemente instalar el wine en otra particion..
1.- Si quieres formatear tu disco, lo primero que debes de tener es un dik de boot, que podes crear con win98, como con winE, de la siguiente manera, Panel de Contol>Añadir o quitar programas>Crear disco de inicio.. alli lo creas un solo disk necesitas tanto como win98 y wimE.
Luego de arrancar tu pc de modo MS-DOS, poniendo en la Bios que Aranque primero con el DISK, te saldra A:, pones A:format a: y alli pones a cero tu disco duro.. Luego con el comando en C:fdisk y le pones la particion primaria...
Volves a reiniciar tu pc, con el disk y le das la obcion de soporte de Cd, luego entras en el cd y le pones d:instalar y desde alli corre solo..
Despuésde terminar le cargas los controladores y listo...
Saludos y suerte..